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                              【允英学术】另辟蹊径|允英携手长征医院报告胃癌患者免疫疗效预测新标志
                              发布时间: 2022-12-1 8:49:31

                              胃癌是全球致死性排行第三的恶性肿瘤疾病,且由于东西方饮食生活习惯差异,以我国为首的东亚诸国发病率尤为突出。胃癌具有复杂的患者组织病理及基因组异质性,使临床患者分层与精准医疗面临严峻挑战。因此,有效鉴定不同胃癌患者基因组中潜在共性特征,对指导临床用药方案、预测疗效及患者预后具有重要意义。

                              近日,允英医疗携手上海长征医院,基于允英自主研发的高效DNA提取技术DNAplus?、液相杂交捕获测序技术AllNGS?,联合生物信息大数据库分析验证,在文章“PIK3CA somatic mutations as potential biomarker for immunotherapy in elder or TP53 mutated gastric cancer patients”中,首次报告老年或携带TP53突变的胃癌患者,存在PIK3CA基因体系突变将导致患者响应免疫治疗的几率提升。相关文章发表于SCI杂志Clinical Genetics(DOI: 10.1111/cge.14260,IF=4.296),第一通讯作者为上海长征医院胃肠外科王伟军主任,由允英医疗CEO张道允博士及研发总监巩子英博士担任共同通讯作者1


                                  本研究总计入组了288例胃癌患者,其中男性198人(68.8%),女性90人(31.3%)。患者平均年龄60岁,中位年龄61岁,男女队列年龄无显著性偏差。所有入组患者均提供肿瘤组织样本,同时使用允英采血管采集并保存配对血液样本。样本中核酸分子经DNAplus?富集提取后,应用允英AllNGS Panel 639?实体瘤全程管理产品,基于Illumina nextSeq550二代测序平台在组织与配对血液样本中检测了与肿瘤发生、发展及患者用药指导、预后评估相关的639个基因的全部外显子与部分内含子上所携带的基因胚系及体系变异。


                                  结果发现,入组患者所检出突变基因与患者基线间相关性极为复杂,为胃癌患者基因组具有高度异质性的论点提供了有力支持。值得注意的是,不同年龄段(≥60岁或<60岁)患者间具有不同的突变背景,表明年龄可能是胃癌患者基因组图谱鉴定的重要影响因素。此外,仅有43.8%(126人)未携带TP53体系突变,且其中多达41.3%(52人)的TP53野生型患者中罕见基因组体系突变,表明其肿瘤突变负荷极低,提示TP53可能是胃癌患者分层的一个潜在分子特征。


                                  随后,本研究将患者分为TP53突变型及TP53野生型队列,并检查了突变频率最高的20个基因与TP53间的协同或拮抗突变模式。结果发现,TP53突变与ARID1A、CDH1、KRAS、LRP1B、PIK3CA突变以及HER2基因扩增表现出统计学显著性相关(p<0.05)。


                                  为了深入评估是否可以基于TP53突变特征建立临床分层管理策略,本研究进一步调查了TP53突变携带者与非携带者的肿瘤突变负荷(Tumor mutation burden,TMB)与不同基因突变间的潜在关系。结果发现,携带PIK3CA突变的患者表现出更高的TMB评分,这一差异在野生型TP53患者队列中表现得更为明显。有趣的是,在年龄≥60岁的患者群体中也表现出了PIK3CA体细胞变异与高TMB评分间极为显著的相关性。


                                  上述结论在包含873名胃癌患者基因组信息的Cbioportal公共数据库中得到了验证,证实了在以TP53突变状态和年龄分组下,CDH1、HER2和PIK3CA与TMB的相关性。我们进一步对35名曾接受了免疫治疗的胃癌患者进行了生存分析,发现在TP53突变或年龄≥60岁的患者群体中,携带PIK3CA突变的患者能够更好的响应免疫治疗,患者总生存期相比非携带者更长、预后更好,尽管这一趋势由于样本量较小而未表现出统计学显著性差异。


                                  综上,本研究首次报道了PIK3CA联合TP53或年龄特征对胃癌患者免疫疗效进行评估具有潜在贡献,相关成果为临床胃癌患者的分层提供了新的思路与视角,并为指导患者个性化的精准医疗及免疫药物获益性预测提供了重要参考依据。



                              参考文献:
                              1. Yao J, You Q, Zhang X, et al. PIK3CA somatic mutations as potential biomarker for immunotherapy in elder or TP53 mutated gastric cancer patients. Clin Genet. 2022;doi:10.1111/cge.14260

                                  允英医疗以长三角区域为中心,辐射全中国,公司致力于打造癌症精准诊疗的新型生态圈,综合运用基因突变检测、基因甲基化检测、基因编辑重组等生物科技的前沿技术,全方位提供从癌症早期精准筛查、癌症靶向用药检测、癌症治疗药物研发一体化的肿瘤精准医学解决方案。目前在上海、浙江及青海共设有三家实验室。

                                  允英医疗成立至今,顺利通过由国家卫健委临检中心、国家病理质控中心、美国病理学会等机构组织的室间质评。检验能力获得了美国病理学会PT认证、国际ISO13485认证,部分试剂盒通过欧盟CE认证。目前允英已累计为二十余万例肿瘤患者提供精准检测服务,为国内肿瘤精准医疗领域开拓者。同时允英秉承“严谨、高效”的理念,坚守分子诊断技术创新与应用探索,为肿瘤精准医疗与伴随诊断领域的茁壮发展贡献力量。



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